Se você usa o portainer com um container padrão, basta seguir o passo a passo:
docker container stop portainer
Depois de parar o portariner, execute o helper usando o mesmo bind ou volume para o que o helper tenha acesso ao banco de dados:
docker run --rm -v portainer_data:/data portainer/helper-reset-password
Caso a operação seja realizada com sucesso, você recebera a nova senha criada:
Password succesfully updated for user: admin
Use the following password to login: &_4#\3^5V8vLTd)E"NWiJBs26G*9HPl1
Agora você pode reiniciar o portainer e use a senha acima para fazer o login.